RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRGV9Q99603 122 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TUBA4BQ9H853 241 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 L7N2F9 121 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GOSR2O14653 212 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VAMP2P63027 116 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 U3KQE9 123 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR4C46A6NHA9 309 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DFFBO76075 338 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CD5P06127 495 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AKR1C1Q04828 323 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C11orf1Q9H5F2 150 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SIX6O95475 246 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTTG1O95997 202 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FABP1P07148 127 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 S100A10P60903 97 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAB32Q13637 225 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF125Q96EQ8 232 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 P2RY1P47900 373 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DLK1P80370 383 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR10P1Q8NGE3 313 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SRD5A3Q9H8P0 318 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RABAC1Q9UI14 185 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMCO3A2RU48 225 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TFPI2P48307 235 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR2F1Q13607 317 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM144Q7Z5S9 345 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GBGT1Q8N5D6 347 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRAMD2BQ96HH9 432 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBQLN2Q9UHD9 624 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BCAP31P51572 246 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARL16Q0P5N6 197 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ODF3L2Q3SX64 289 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SSNA1O43805 119 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CAV2P51636 162 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LYZP61626 148 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPL11P62913 178 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PAFAH1B2P68402 229 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C16orf54Q6UWD8 224 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM24AA6NFZ4 105 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FNDC10F2Z333 226 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NMES1Q9C002 83 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MS4A6AQ9H2W1 248 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BUB3O43684 328 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WFDC3Q8IUB2 231 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GLMPQ8WWB7 406 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CITED4Q96RK1 184 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NPVFQ9HCQ7 196 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CFDP00746 253 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H2BFSP57053 126 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HAGHQ16775 308 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM110AQ9BQ89 295 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GGACTQ9BVM4 153 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAV2A0A0B4J234 112 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DEDDO75618 318 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYCSP99999 105 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BPIFCQ8NFQ6 507 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TM2D3Q9BRN9 247 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ALG5Q9Y673 324 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 U3KQK5 164 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HELTA6NFD8 242 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CST7O76096 145 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STXBP6Q8NFX7 210 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC38A11Q08AI6 406 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM252Q8N6L7 170 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STPG3Q8N7X2 389 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZMAT4Q9H898 229 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAP6D1Q9H9H5 199 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PFDN2Q9UHV9 154 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGSF23A1L1A6 192 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TEPPQ6URK8 271 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM217Q8N7C4 229 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 K7EQG2 157 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RLN2P04090 185 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SULT1A1P50225 295 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 APRG1Q8IVJ8 170 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM24BQ8N5W8 94 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms