RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 GFRA3O60609 400 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 NDUFA3O95167 84 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM50AO95807 157 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 RAX2Q96IS3 184 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 UBE2L6O14933 153 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV2-70P01814 119 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 TYMSP04818 313 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.22□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 PPBPP02775 128 aa9.21□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 LINC00205P59089 165 aa9.21□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 CSRP2Q16527 193 aa9.21□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.21□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.21□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF585BQ52M93 769 aa9.21□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.21□□□□□ -0.93
SEMA4D-211ENST00000438547 TSC2P49815 1807 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 C3orf79P0CE67 100 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 CD24P25063 80 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 Q0VFX4 171 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 LCN12Q6JVE5 192 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 RRN3P1Q2M238 152 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 RASL11AQ6T310 242 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.21□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PDLIM4P50479 330 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 ATP5J2P56134 94 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 COPS9Q8WXC6 57 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 WISP1O95388 367 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 A8MWP6 167 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 H7C1H1 209 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 DPM2O94777 84 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 TDGF1P3P51864 188 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SEC11AP67812 179 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.2□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 MYOD1P15172 320 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF524Q96C55 264 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 DUX5Q96PT3 197 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A0G2JLM5 398 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SIGMAR1Q99720 223 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 TIMM23O14925 209 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 LYNX1P0DP58 116 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PSG1P11464 419 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SCGB1A1P11684 91 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 TNFRSF14Q92956 283 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 TCRAP04437 139 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PRR31Q5SQ13 230 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 NUP35Q8NFH5 326 aa9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 LIME1Q9H400 295 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 MRAP2Q96G30 205 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 MLNRO43193 412 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PAX9P55771 341 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 HSD52Q0P140 79 aa9.18□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 MGAMO43451 1857 aa9.17□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 NPFFO15130 113 aa9.17□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 UBE2V1Q13404 147 aa9.17□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SEMA4D-211ENST00000438547 THADAQ6YHU6 1953 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms