RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 IGFL3Q6UXB1 125 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE12BA1L429 117 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 C15orf61A6NNL5 157 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM178BH3BS89 294 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GUSBP1Q15486 140 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 C1QL4Q86Z23 238 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 MBD3L1Q8WWY6 194 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GNB4Q9HAV0 340 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 KIR2DS2P43631 304 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 HERV-K104P63124 156 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 CAMPP49913 170 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GNG4P50150 75 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 TIGITQ495A1 244 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GUS0 222 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 CEACAM4O75871 244 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 IER3P46695 156 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 LCN2P80188 198 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 RITA1Q96K30 269 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00479Q96M42 142 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 CTSZQ9UBR2 303 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 H3BVH4 76 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 J3KRW8 73 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GCHFRP30047 84 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 MANBALQ9NQG1 85 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 CXorf1O96002 111 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 BRS3P32247 399 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 EFNB3Q15768 340 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 RPEL1Q2QD12 228 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 OR8B2Q96RD0 313 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF114Q8NC26 417 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 UPK2O00526 184 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 CBLN1P23435 193 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4C13Q8NGP0 309 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 HELTA6NFD8 242 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 CCL25O15444 150 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 FABP2P12104 132 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2G1P62253 170 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GNG5P63218 68 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 E7EUB6 86 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 K7ENP7 123 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 LIPFP07098 398 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 AREGP15514 252 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 CRYBA4P53673 196 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 HEPN1Q6WQI6 88 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V0BQ99437 205 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 NBL1P41271 181 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 TAS2R45P59539 299 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 PRSS8Q16651 343 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GBGT1Q8N5D6 347 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 F2RL2O00254 374 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM222BQ8WU58 562 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 H3BUT2 72 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 FOLR2P14207 255 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB1CQ92928 201 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 A6NDN8 102 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE1Q13065 139 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 CDSNQ15517 529 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms