RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 COMMD3Q9UBI1 195 aa10.53□□□□□ -0.72
ACTBP11-201ENST00000436287 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa10.53□□□□□ -0.72
ACTBP11-201ENST00000436287 CDS2O95674 445 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ID1P41134 155 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 PSMB3P49720 205 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 DAD1P61803 113 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 PSG9Q00887 426 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 Q8N1X5 172 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ACY3Q96HD9 319 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC35B3Q9H1N7 401 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 SOCS3O14543 225 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 CD3DP04234 171 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ELK1P19419 428 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 PAX9P55771 341 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 RRN3P1Q2M238 152 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 GSG1LQ6UXU4 331 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 C6orf223Q8N319 242 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 TERB2Q8NHR7 220 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 YIPF6Q96EC8 236 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF125Q96EQ8 232 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ATG101Q9BSB4 218 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM222Q9H0R3 208 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 NACAE9PAV3 2078 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAH5Q8TE73 4624 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 CEBPZOSA8MTT3 80 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 TBPP20226 339 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ALDH3B2P48448 385 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 OR8G2PQ6IF36 304 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 NOXA1Q86UR1 476 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 OR13C8Q8NGS7 320 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 COQ8AQ8NI60 647 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 GPR146Q96CH1 333 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ABHD1Q96SE0 405 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 CACNG5Q9UF02 275 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 APOBP04114 4563 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A0J9YX75 114 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 F6UB75 175 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 OR5AC1P0C628 307 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 RORCP51449 518 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 NMSQ5H8A3 153 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM78BQ5VT40 261 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 EBLN2Q6P2I7 272 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 PBDC1Q9BVG4 233 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ISLRO14498 428 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 HPGDSO60760 199 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 OR52I2Q8NH67 350 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 MAGT1Q9H0U3 335 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 MTFP1Q9UDX5 166 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 HERC1Q15751 4861 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 SCRT2Q9NQ03 307 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 CACFD1Q9UGQ2 172 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 U3KQ87 197 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 LYRM9A8MSI8 78 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 A8MTW9 85 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF90Q03938 601 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 MEF2DQ14814 521 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 AMTNQ6UX39 209 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM208Q9BTX3 173 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 NAA60Q9H7X0 242 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 DOK5Q9P104 306 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTBP11-201ENST00000436287 ZFP92A6NM28 416 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 SNRPGP15A8MWD9 76 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 TNFAIP8O95379 198 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 RAB3DO95716 219 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 NCS1P62166 190 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM268Q5VZI3 342 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 C20orf173Q96LM9 149 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 RPRMQ9NS64 109 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM25AB3EWG3 89 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM25CB3EWG5 89 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms