RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SOSTQ9BQB4 213 aa15.21■□□□□ 0.03
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LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa15.2■□□□□ 0.02
LIMS1-208ENST00000428064 ACY3Q96HD9 319 aa15.2■□□□□ 0.02
LIMS1-208ENST00000428064 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
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LIMS1-208ENST00000428064 PSG1P11464 419 aa15.19■□□□□ 0.02
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA3P12429 323 aa15.19■□□□□ 0.02
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LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D24Q9ULP9 559 aa15.19■□□□□ 0.02
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LIMS1-208ENST00000428064 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-208ENST00000428064 NOL3O60936 208 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
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LIMS1-208ENST00000428064 AKR1C4P17516 323 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-208ENST00000428064 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-208ENST00000428064 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
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LIMS1-208ENST00000428064 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
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LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DRB4P13762 266 aa15.15■□□□□ 0.02
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LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.15■□□□□ 0.02
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa15.14■□□□□ 0.01
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LIMS1-208ENST00000428064 HERC2O95714 4834 aa15.08■□□□□ 0
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LIMS1-208ENST00000428064 GDF5OSQ5U4N7 250 aa15.08■□□□□ 0
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