RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5B12Q96R08 314 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF492Q9P255 531 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 IZUMO1RA6ND01 250 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DRB1P01911 266 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLC1P0CG04 106 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL8P62917 257 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM71F2Q6NXP2 309 aa2.88□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01545Q5VT33 79 aa2.88□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 HELTA6NFD8 242 aa2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 C18orf15Q96N68 181 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00312Q9Y6C7 94 aa2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF90Q03938 601 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM12Q96EX1 92 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35E1Q96K37 410 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 PRNDQ9UKY0 176 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM181BA6NEQ2 426 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 DPRXA6NFQ7 191 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SSX8Q7RTT4 187 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 J3QR06 171 aa2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 HCP5Q6MZN7 132 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 CNFNQ9BYD5 112 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT10AQ9GZT5 417 aa2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 WNK1Q9H4A3 2382 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SORL1Q92673 2214 aa2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 HES3Q5TGS1 186 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS33Q8NF86 280 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2Z1Q8NG97 314 aa2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 DIRC3C9JPN6 131 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 MOSP00540 346 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 MCEMP1Q8IX19 187 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF14Q92956 283 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 AJUBAQ96IF1 538 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 ADTRPQ96IZ2 230 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01546A6NGU7 62 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 I3L2K1 104 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TCL1AP56279 114 aa2.86□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 CST9LP1Q5W188 147 aa2.86□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 GPR82Q96P67 336 aa2.86□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 PARD6AQ9NPB6 346 aa2.86□□□□□ -1.95
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PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC10Q5BKY1 277 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR73Q6P4I2 378 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 CFHR4Q92496 578 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIB1Q96RU8 372 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 S1PR3Q99500 378 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM167BQ9NRX6 74 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 UQCR10Q9UDW1 63 aa2.86□□□□□ -1.95
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