RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CXorf65A6NEN9 183 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 I3L2K1 104 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 NPFFO15130 113 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 GOSR1O95249 250 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PYYP10082 97 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 BRS3P32247 399 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 NDPQ00604 133 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ARPC1AQ92747 370 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF2Q99496 336 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TRGV9Q99603 122 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF24Q9Y225 148 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPEQ02224 2701 aa3.15□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 H7BYZ3 331 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PSG1P11464 419 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 FOLR2P14207 255 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CRYBB3P26998 211 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 EBI3Q14213 229 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TIGITQ495A1 244 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N6K4 173 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 AJUBAQ96IF1 538 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 YPEL4Q96NS1 127 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PAXXQ9BUH6 204 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 OR51M1Q9H341 326 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 C1RLQ9NZP8 487 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 POLQO75417 2590 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 K7EIM0 57 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFS8O00217 210 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 HYPMO75409 117 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 S100A6P06703 90 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLC1P0CG04 106 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 COX6B1P14854 86 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 LYZP61626 148 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PAX8Q06710 450 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 COTL1Q14019 142 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 LEMD1Q68G75 181 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01551Q86U37 167 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N9W7 124 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 HELTA6NFD8 242 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 GGTLC3B5MD39 225 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM229AH3BQW9 127 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 GALR1P47211 349 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 OCC1Q8TAD7 63 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 BLNKQ8WV28 456 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM210BQ96KR6 192 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5B12Q96R08 314 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 BIN3Q9NQY0 253 aa3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV20A0A0B4J274 112 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PRE2 83 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 VWC2LB2RUY7 222 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BTX0 84 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2J3O76001 311 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1-17P01599 117 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-23P01764 117 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 RD3LP0DJH9 198 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 AKR1D1P51857 326 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 RANP62826 216 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM219Q86XT9 240 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 WFDC3Q8IUB2 231 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 X6R8D5 127 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPN13Q12923 2485 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0U1RQK1 487 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PPQ1 181 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 GNG7O60262 68 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1-69P01742 117 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.13□□□□□ -1.91
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