RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 RNF24Q9Y225 148 aa15□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa15□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 HELTA6NFD8 242 aa15□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 ISLRO14498 428 aa15□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 hADV38S2A0JD32 116 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 TAX1BP3O14907 124 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 DTX2Q86UW9 622 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 PRSS46E5RG02 174 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 NDUFB3O43676 98 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 SLC35B1P78383 322 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.99□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 TCL1AP56279 114 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 UBE2G1P62253 170 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 Q56UQ5 140 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 ZNF714Q96N38 554 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 IZUMO1RA6ND01 250 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 PSG1P11464 419 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 DLX6P56179 175 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 RELBQ01201 579 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 FXYD3Q14802 87 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 TNXAQ16473 311 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 TIGITQ495A1 244 aa14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 HSBP1O75506 76 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 FOXH1O75593 365 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 MYOD1P15172 320 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 REG1BP48304 166 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 M0R2Z0 102 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 TOX4O94842 621 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 IGKV1-16P04430 117 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 RASL11AQ6T310 242 aa14.97□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 C2orf70A6NJV1 201 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 CT45A6P0DMU7 189 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 CT45A5P0DMU8 189 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 CT45A7P0DMV0 189 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 SLAQ13239 276 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 MPV17L2Q567V2 206 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 OR4A47Q6IF82 309 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 C1orf159Q96HA4 380 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 ST20Q9HBF5 79 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 LRRK2Q5S007 2527 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX11-201ENST00000359238 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 CRYBB3P26998 211 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 DEFB125Q8N687 156 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 PLXNB1O43157 2135 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 J3QR06 171 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 K7ERU9 68 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 STPG3Q8N7X2 389 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 ZNF596Q8TC21 504 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 S1PR3Q99500 378 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 ERASQ7Z444 233 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 OR52E5Q8NH55 327 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 SMIM12Q96EX1 92 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 CHD6Q8TD26 2715 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 IGLV2-8P01709 118 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 PRR27Q6MZM9 219 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 C1RLQ9NZP8 487 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 OR2T8A6NH00 312 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TMEM238C9JI98 176 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 RAB9BQ9NP90 201 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TEPPQ6URK8 271 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 NUDT11Q96G61 164 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TMEM140Q9NV12 185 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms