RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 RHOGP84095 191 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 EPDR1Q9UM22 224 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 TDGF1P13385 188 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 CRYBA2P53672 197 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 B4DSR2 109 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 ID3Q02535 119 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 FAM27E3Q08E93 113 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 MGST2Q99735 147 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 CRYGSP22914 178 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 PRADC1Q9BSG0 188 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GWB2 263 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 IFITM2Q01629 132 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 EFNB3Q15768 340 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 VGLL1Q99990 258 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 AGMATQ9BSE5 352 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 SLC25A16P16260 332 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 HAPLN4Q86UW8 402 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 GGTLC3B5MD39 225 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 MIR17HGQ75NE6 70 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 SLC25A15Q9Y619 301 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 HSD52Q0P140 79 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 C15orf32Q32M92 178 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 LAIR2Q6ISS4 152 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 NRN1Q9NPD7 142 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0G2JMM0 328 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PPB8 328 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PRS3 328 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 NAPSAO96009 420 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 ATXN8Q156A1 80 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 TEX38Q6PEX7 206 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 RNF222A6NCQ9 220 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 HCFC1P51610 2035 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GWJ7 208 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 ZNF585BQ52M93 769 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 CD28P10747 220 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 NOTCH4Q99466 2003 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 FOXL2P58012 376 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 CELA3BP08861 270 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 CTAG1AP78358 180 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 CT83Q5H943 113 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 IGKCP01834 107 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 H3BTX0 84 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 NDUFB8O95169 186 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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PTPRT-201ENST00000356100 LINC00477Q96M19 166 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 RAMP1O60894 148 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 TREML4Q6UXN2 200 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-201ENST00000356100 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.98□□□□□ -1.61
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