RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 TCTAP57738 103 aa10.46□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CR1LQ2VPA4 569 aa10.46□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.46□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.46□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 PERPQ96FX8 193 aa10.46□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM133Q9H2Q1 129 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TCF15Q12870 199 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 KLRD1Q13241 179 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 PRSS33Q8NF86 280 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 NUDT11Q96G61 164 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 NRN1Q9NPD7 142 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 M0R2Z0 102 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM183BQ1AE95 376 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM177Q53S58 311 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 WDR73Q6P4I2 378 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.45□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 COL8A1P27658 744 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TFPI2P48307 235 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 PATE2Q6UY27 113 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 A0A1W2PRE2 83 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CHEK1O14757 476 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 AMY1AP04745 511 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 MC5RP33032 325 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 C9JCJ5 164 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 FCN3O75636 299 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 P01737 135 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 NEU1Q99519 415 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.44□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SLAQ13239 276 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 NUP37Q8NFH4 326 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ITGB1BP1O14713 200 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 PAFAH1B2P68402 229 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TBR1Q16650 682 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CX3CL1P78423 397 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.43□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 COL12A1Q99715 3063 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 Q6ZN92 141 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 OSTCQ9NRP0 149 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TIMM23O14925 209 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 PSG1P11464 419 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF138P52744 262 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SELENOTP62341 195 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 POU2AF1Q16633 256 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 SPATA45Q537H7 98 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 C22orf46C9J442 243 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 BMPR1BO00238 502 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 AARDQ4LEZ3 155 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 Q8NA96 180 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 NUP35Q8NFH5 326 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 Q9H3A6 140 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 EPDR1Q9UM22 224 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.42□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 CSPG4Q6UVK1 2322 aa10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 HLA-DQA1P01909 254 aa10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TAS2R60P59551 318 aa10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF329Q86UD4 541 aa10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 C11orf52Q96A22 123 aa10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 RNF2Q99496 336 aa10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.41□□□□□ -0.74
LRTM2-201ENST00000299194 LGALS7P47929 136 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms