RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 PFDN5Q99471 154 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CHRDL1Q9BU40 450 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 COX7A2P2O60397 106 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHV3-11P01762 117 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RHOBP62745 196 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SPSB3Q6PJ21 355 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF152Q8N8N0 203 aa16.06■□□□□ 0.16
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PACSIN3-201ENST00000298838 TEX46H3BTG2 121 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACSIN3-201ENST00000298838 OR1B1Q8NGR6 318 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACSIN3-201ENST00000298838 PFDN2Q9UHV9 154 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACSIN3-201ENST00000298838 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACSIN3-201ENST00000298838 C10orf113Q5VZT2 155 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4X2Q8NGF9 303 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01006Q8NI28 216 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MYOZ3Q8TDC0 251 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACSIN3-201ENST00000298838 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GV50 99 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MAST4O15021 2626 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 HYPMO75409 117 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2C1O95371 312 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 IL4P05112 153 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF600Q6ZNG1 722 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PBDC1Q9BVG4 233 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MED9Q9NWA0 146 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 FUT9Q9Y231 359 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP5D1E7EU14 171 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ARL3P36405 182 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RELQ04864 619 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF125Q96EQ8 232 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PATE2Q6UY27 113 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4F5Q8NH21 305 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2E2Q96LR5 201 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-201ENST00000298838 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 COMMD7Q86VX2 200 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 UHRF2Q96PU4 802 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 HIGD1AQ9Y241 93 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TRBV12-3P01733 135 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 IL34Q6ZMJ4 242 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 MIR17HGQ75NE6 70 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00305Q7Z4B0 112 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 OR5B12Q96R08 314 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 NUDT19A8MXV4 375 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TAS2R45P59539 299 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 STAG3L2P0CL84 134 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 STAG3L3P0CL85 134 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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PACSIN3-201ENST00000298838 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 KHDC3LQ587J8 217 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 S100A7AQ86SG5 101 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 MARC2Q969Z3 335 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 BMPR1BO00238 502 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CXorf1O96002 111 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ARL14EPLP0DKL9 152 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CCL20P78556 96 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.98■□□□□ 0.15
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