RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 MSGN1A6NI15 193 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 M0R2P5 195 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CD28P10747 220 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 IGKV3-20P01619 116 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PRCDQ00LT1 54 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 COQ2Q96H96 371 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TNFSF13O75888 250 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 BTCP35070 178 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 C1QCP02747 245 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 FAM168AQ92567 244 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SPSB2Q99619 263 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 A0A1W2PRS3 328 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 JMJD8Q96S16 334 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 FOXL1Q12952 345 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3-48P01763 117 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CD7P09564 240 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 RHOGP84095 191 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF479Q96JC4 524 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PRR19A6NJB7 356 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 IGLV3-19P01714 112 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 FBXL15Q9H469 300 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TEX38Q6PEX7 206 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LINC00614P0C842 121 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CRYBA2P53672 197 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SLC25A28Q96A46 364 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ZIC3O60481 467 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TIMP3P35625 211 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 GNG5P63218 68 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TRGV9Q99603 122 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PRR32B1ATL7 298 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 GAGE2EQ4V326 116 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SPRED2Q7Z698 418 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 RNF126Q9BV68 326 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 RAMP3O60896 148 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 COL4A1P02462 1669 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ERG28Q9UKR5 140 aa6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CEACAM1P13688 526 aa6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 J3QRE1 110 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 GAGE2BQ13066 116 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 C1QTNF9P0C862 333 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 EGR1P18146 543 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 EFNB3Q15768 340 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 MORN2Q502X0 79 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CT83Q5H943 113 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 C17orf100A8MU93 164 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 SP9P0CG40 484 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3-23P01764 117 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 PSG8Q9UQ74 426 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 STHQ8IWL8 128 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 RNF5Q99942 180 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 DSCR9P59020 149 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 PROB1E7EW31 1015 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ESDP10768 282 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.1 ms