RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 IGKV3-20P01619 116 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 LYNX1P0DP58 116 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZNF56Q15929 161 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MIC13Q5XKP0 118 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 GPR146Q96CH1 333 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 C18orf15Q96N68 181 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 A0A087WX48 190 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PINLYPA6NC86 204 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZNF488Q96MN9 340 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MGST2Q99735 147 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FOXF2Q12947 444 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 KLK15Q9H2R5 256 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ATP5LO75964 103 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 CXCL1P09341 107 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PRTN3P24158 256 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 CX3CL1P78423 397 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TMEM178BH3BS89 294 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PIGYQ3MUY2 71 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 UBE2E1P51965 193 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PRCDQ00LT1 54 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZNF585BQ52M93 769 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FOXC2Q99958 501 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZNF815PA8K554 130 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 GZMBP10144 247 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MPV17L2Q567V2 206 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ICAM4Q14773 271 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZNF146Q15072 292 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PRSS47A8MTI9 375 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 CD5LO43866 347 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGHV4-39P01824 125 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PAX8Q06710 450 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 EFNB3Q15768 340 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 GCHFRP30047 84 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 RHOGP84095 191 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PRELID3AQ96N28 172 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TMEM238C9JI98 176 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 INSP01308 110 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 C8orf88P0DMB2 117 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 CDKN1BP46527 198 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 RND2P52198 227 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 F8VVB4 439 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 F8VWA3 439 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PPP1R17O96001 155 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PSG7Q13046 419 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TMEM187Q14656 261 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TMEM86BQ8N661 226 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SSTR5P35346 364 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 VOPP1Q96AW1 172 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 E7EQL1 145 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TNFRSF6BO95407 300 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ELANEP08246 267 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ASIPP42127 132 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 NABP2Q9BQ15 211 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 RAMP3O60896 148 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-201ENST00000268049 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-201ENST00000268049 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-201ENST00000268049 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-201ENST00000268049 TEX45Q8NA69 505 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-201ENST00000268049 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms