RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PS18 150 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-48P01763 117 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 CSN3P07498 182 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPI3 338 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 IL4P05112 153 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZWC4 215 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NIT1Q86X76 327 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 OOSP1A8MZH6 123 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 SIAH2O43255 324 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 ST20Q9HBF5 79 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 A6NDN8 102 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 MLANAQ16655 118 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 OR4C46A6NHA9 309 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 PROP1O75360 226 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 FAM87AP0C7U9 286 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 C3orf79P0CE67 100 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 TCF24Q7RTU0 167 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 RNF125Q96EQ8 232 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 M0R1W7 72 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 ARPC1AQ92747 370 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 FXYD5Q96DB9 178 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 EREGO14944 169 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 LINC00614P0C842 121 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 WT1-ASQ06250 92 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 SPRNQ5BIV9 151 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.13□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 SGK494Q96LW2 274 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 H3BTX0 84 aa7.13□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 PSG1P11464 419 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.13□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 KLRB1Q12918 225 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 ZNF124Q15973 351 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 Q86TA4 180 aa7.13□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.12□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.12□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.12□□□□□ -1.27
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HERC3-201ENST00000264345 DLEU1O43261 78 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 OR2J3O76001 311 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 CKS2P33552 79 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 CDKN1AP38936 164 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-201ENST00000264345 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.12□□□□□ -1.27
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