RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 C4orf3Q8WVX3 66 aa20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 DOK5Q9P104 306 aa20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 YIF1AO95070 293 aa20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 RD3LP0DJH9 198 aa20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 FFAR4Q5NUL3 377 aa20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 SLC39A9Q9NUM3 307 aa20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 TIMM9Q9Y5J7 89 aa20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 TOMM40O96008 361 aa20.06■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 RPL29P47914 159 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 IFITM2Q01629 132 aa20.06■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa20.06■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa20.05■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 SPSB3Q6PJ21 355 aa20.05■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 ATP6V0BQ99437 205 aa20.05■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 LYZP61626 148 aa20.05■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 TEX261Q6UWH6 196 aa20.05■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 RAB2AP61019 212 aa20.04■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 OR51G1Q8NGK1 321 aa20.04■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.04■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 COL6A5A8TX70 2615 aa20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 GGCTO75223 188 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 SCGB2A1O75556 95 aa20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 TSPAN15O95858 294 aa20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 IL4P05112 153 aa20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 SEC11BP0C7V7 166 aa20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 SELENOTP62341 195 aa20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 TOMM20LQ6UXN7 152 aa20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF600Q6ZNG1 722 aa20.03■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 ORM2P19652 201 aa20.02■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa20.02■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 OR11H1Q8NG94 326 aa20.02■□□□□ 0.8
TOMM40-201ENST00000252487 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 SLURP1P55000 103 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 FAM209BQ5JX69 171 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF680Q8NEM1 530 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 OR1B1Q8NGR6 318 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 Q8WTZ3 238 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 RAX2Q96IS3 184 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 ZFAND3Q9H8U3 227 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 KCNIP2Q9NS61 270 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 STAB1Q9NY15 2570 aa20.02■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 WNK1Q9H4A3 2382 aa20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 FABP1P07148 127 aa20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 FHITP49789 147 aa20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 RELQ04864 619 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 RPEL1Q2QD12 228 aa20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 PATE2Q6UY27 113 aa20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 OR1N2Q8NGR9 330 aa20.01■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 RNF125Q96EQ8 232 aa20■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 C20orf24Q9BUV8 137 aa20■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 SERF2P84101 59 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 Q6ZRG5 221 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM37Q8WXS4 190 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM158Q8WZ71 300 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 PHYHIPLQ96FC7 376 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 UHRF2Q96PU4 802 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 RPRMQ9NS64 109 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 LINC01619G3V211 115 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 OR5G3P0C626 314 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 CITED1Q99966 193 aa19.99■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF320A2RRD8 509 aa19.98■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa19.98■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 DPF1Q92782 380 aa19.98■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 COX7A2P2O60397 106 aa19.97■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM41BQ5BJD5 291 aa19.97■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 FAM122CQ6P4D5 195 aa19.97■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 NDUFA11Q86Y39 141 aa19.97■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 OR10G4Q8NGN3 311 aa19.97■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 OR10G9Q8NGN4 311 aa19.97■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 OR10G7Q8NGN6 311 aa19.97■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 NDUFA4O00483 81 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 M6PRP20645 277 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 EDN2P20800 178 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 SYNJ2BPP57105 145 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 MORN5Q5VZ52 161 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 SSX7Q7RTT5 188 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 CCL24O00175 119 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 HYPMO75409 117 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 FAM213BQ8TBF2 198 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 SLC25A22Q9H936 323 aa19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TOMM40-201ENST00000252487 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa19.95■□□□□ 0.78
TOMM40-201ENST00000252487 SULT1A2P50226 295 aa19.95■□□□□ 0.78
TOMM40-201ENST00000252487 PLP1P60201 277 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms