RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 CST9LQ9H4G1 147 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 HERV-K104P63124 156 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM250H0YL14 139 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 MMP23AO75900 390 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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PRRX1-201ENST00000239461 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-201ENST00000239461 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.65□□□□□ -1.02
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PRRX1-201ENST00000239461 PMCHP20382 165 aa8.65□□□□□ -1.02
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PRRX1-201ENST00000239461 CGB7P0DN87 165 aa8.65□□□□□ -1.03
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PRRX1-201ENST00000239461 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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PRRX1-201ENST00000239461 C2orf83Q53S99 150 aa8.63□□□□□ -1.03
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PRRX1-201ENST00000239461 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.63□□□□□ -1.03
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PRRX1-201ENST00000239461 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.63□□□□□ -1.03
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PRRX1-201ENST00000239461 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.63□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.63□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.63□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.63□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.63□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 FNDC10F2Z333 226 aa8.62□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFS7O75251 213 aa8.62□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 P0C879 139 aa8.62□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.62□□□□□ -1.03
PRRX1-201ENST00000239461 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.62□□□□□ -1.03
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