RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 EVI2AP22794 236 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TM4SF5O14894 197 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 CD33P20138 364 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 JMJD8Q96S16 334 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGHV3-23P01764 117 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 CELA3BP08861 270 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PSG3Q16557 428 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SHISA5Q8N114 240 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 LINC00271P0C7V0 271 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GWJ7 208 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 GAGE1Q13065 139 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 NPPCP23582 126 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 DDB2Q92466 427 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 GUSBP1Q15486 140 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 NRN1LQ496H8 165 aa8.5□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 OR9G9P0C7N8 305 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ASIPP42127 132 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGKCP01834 107 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 WBP1Q96G27 269 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ZNF815PA8K554 130 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 CDKN1AP38936 164 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 C9JQL5 133 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PSG7Q13046 419 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 NPFFO15130 113 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 CECR9P0C854 216 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ITGB1BP1O14713 200 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGKV3-20P01619 116 aa8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 HGFACQ04756 655 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 C9JCJ5 164 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 CEACAM4O75871 244 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 MST1LQ2TV78 715 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TMEM101Q96IK0 257 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 CELA3AP09093 270 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 NMSQ5H8A3 153 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SORL1Q92673 2214 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 AZU1P20160 251 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SPG11Q96JI7 2443 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 UPK2O00526 184 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 C3orf79P0CE67 100 aa8.48□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 CD5LO43866 347 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ATXN8Q156A1 80 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 RASL11AQ6T310 242 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 QRFPP83859 136 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FBXL15Q9H469 300 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 MORN2Q502X0 79 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FAM201AQ5SY85 155 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TREML4Q6UXN2 200 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SAP25Q8TEE9 199 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ERG28Q9UKR5 140 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 H3BRM9 83 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 YPEL1O60688 119 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FOXH1O75593 365 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TMPRSS3P57727 454 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 YPEL2Q96QA6 119 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 CCL21O00585 134 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FAM166AQ6J272 317 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 H7C1H1 209 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PRR31Q5SQ13 230 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PRR7Q8TB68 274 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FAM231BA6NCW3 169 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 GLRXP35754 106 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 MRAPQ8TCY5 172 aa8.47□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ASCL2Q99929 193 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms