RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 CNIH1O95406 144 aa14.79□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 MOSP00540 346 aa14.79□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 IGHV3-48P01763 117 aa14.79□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 MMDQ15546 238 aa14.79□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.79□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.79□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 FABP1P07148 127 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 PLP1P60201 277 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 ERVFC1-1P60608 527 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 NPBQ8NG41 125 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 OSTCQ9NRP0 149 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 XKRY2A2RUG3 117 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 RPEL1Q2QD12 228 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 MORN5Q5VZ52 161 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 CFHR4Q92496 578 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-211ENST00000636934 ORM2P19652 201 aa14.77□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.77□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.77□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 NDUFA3O95167 84 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 GCGP01275 180 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 FXYD5Q96DB9 178 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 A6NNC1 897 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 FCN1O00602 326 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 APELAP0DMC3 54 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 PYYP10082 97 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 PDLIM4P50479 330 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 DNLZQ5SXM8 178 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 ZNF329Q86UD4 541 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 KALRNO60229 2985 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 I3L2K1 104 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 ISLRO14498 428 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 EFNA4P52798 201 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 PEX7O00628 323 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 FABP4P15090 132 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 LGALS4P56470 323 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 KLRD1Q13241 179 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 V9GYV3 84 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 ABCA4P78363 2273 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 HES1Q14469 280 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 COX19Q49B96 90 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 SLC17A3O00476 420 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 IGLC1P0CG04 106 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 CDKN1AP38936 164 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 OR5I1Q13606 314 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 FXYD3Q14802 87 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 PYY3Q5JQD4 70 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 IGLV2-8P01709 118 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 MYCNOSP40205 109 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-211ENST00000636934 A0A1W2PPR1 153 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 S100A7AQ86SG5 101 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 SMIM12Q96EX1 92 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 PSG1P11464 419 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 LYZP61626 148 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 WDR73Q6P4I2 378 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 BAGE2Q86Y30 109 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 EPDR1Q9UM22 224 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 ATRXP46100 2492 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms