RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM16LQ309B1 348 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SP6Q3SY56 376 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 XCL2Q9UBD3 114 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BMM0 161 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 M0R2N4 97 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 CD3DP04234 171 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 ELK1P19419 428 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 NPY1RP25929 384 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 HTR2BP41595 481 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RND2P52198 227 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SPCS3P61009 180 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 DHODHQ02127 395 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 AARDQ4LEZ3 155 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZRM9 215 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 Q8WTZ3 238 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 NRN1Q9NPD7 142 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 COPZ2Q9P299 210 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 KLK11Q9UBX7 282 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 HPGDSO60760 199 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GALNT1O75752 331 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 CD74P04233 296 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 IL4P05112 153 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A4P12235 298 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 HLA-DRB4P13762 266 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 TBPP20226 339 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10J1P30954 320 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 NCS1P62166 190 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf83Q53S99 150 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM219AQ8IW50 185 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52E5Q8NH55 327 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 NEU1Q99519 415 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM189A5PLL7 270 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 BUB3O43684 328 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 NXPH3O95157 252 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 CDS2O95674 445 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52I2Q8NH67 350 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 TERB2Q8NHR7 220 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM25AB3EWG3 89 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM25CB3EWG5 89 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM25GB3EWG6 89 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 TOMM40O96008 361 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNA10P01566 189 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5AC1P0C628 307 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RD3LP0DJH9 198 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 VBP1P61758 197 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZR54 194 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 NPIPB3Q92617 1050 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM210BQ96KR6 192 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 CACNG5Q9UF02 275 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPG2P98160 4391 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087WXM4 84 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNA21P01568 189 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 PSG1P11464 419 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 RORCP51449 518 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 EMP1P54849 157 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-226ENST00000593200 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms