RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 MOB3BQ86TA1 216 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM12Q96EX1 92 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMB11A5LHX3 300 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 GGTLC3B5MD39 225 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 K7EN84 100 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL21O00585 134 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FCN3O75636 299 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV1-47P01700 117 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CEACAM3P40198 252 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 LGALS4P56470 323 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 RANP62826 216 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFA6Q01524 100 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 S100A7AQ86SG5 101 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 NPIPB3Q92617 1050 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ZMAT4Q9H898 229 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNA1DQ01668 2161 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SVILO95425 2214 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CGB1A6NKQ9 187 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX7O00628 323 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 HYPMO75409 117 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SCGB2A1O75556 95 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYGCP07315 174 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYGBP07316 175 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 COX7A1P24310 79 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TPPP2P59282 170 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2G1P62253 170 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PAFAH1B2P68402 229 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PLGLAQ15195 96 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 RASL11AQ6T310 242 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF503Q96F45 646 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 V9GYV3 84 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ACACBO00763 2458 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 M0R1W7 72 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FCN1O00602 326 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 HLA-DQA1P01909 254 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 AMY1AP04745 511 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CRISP2P16562 243 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF329Q86UD4 541 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01560Q8TB33 94 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FXYD5Q96DB9 178 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF24Q9Y225 148 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SNURFLB1AK76 121 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC17A3O00476 420 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 REG1AP05451 166 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CBLN1P23435 193 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 HTR1DP28221 377 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IER3P46695 156 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms