RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-216	ENST00000588477	DEFB1	P60022	68 aa		10.8	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	OXA1L	Q15070	435 aa		10.8	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.8	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	SPART	Q8N0X7	666 aa		10.8	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	C6orf223	Q8N319	242 aa		10.8	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477		Q8WTZ3	238 aa		10.8	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	ATG101	Q9BSB4	218 aa		10.8	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	HERC1	Q15751	4861 aa		10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	GABARAPL2	P60520	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	DHODH	Q02127	395 aa		10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	IL4	P05112	153 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	PRSS3	P35030	304 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	AKR1C2	P52895	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	DAD1	P61803	113 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
IFT20-216	ENST00000588477	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	BUB3	O43684	328 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	HBE1	P02100	147 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477		P0C879	139 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	HSPA13	P48723	471 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	UCP3	P55916	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	FCGR1B	Q92637	280 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	OR10J1	P30954	320 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RND2	P52198	227 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	BSX	Q3C1V8	233 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	TP53RK	Q96S44	253 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	PGAM2	P15259	253 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RRN3P1	Q2M238	152 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	TMEM127	O75204	238 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	ATG12	O94817	140 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	PI3	P19957	117 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	VCX3B	Q9H321	246 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	NUDT3	O95989	172 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	SLC25A4	P12235	298 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	ID1	P41134	155 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	HTR2B	P41595	481 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RORC	P51449	518 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	PIGP	P57054	158 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RND3	P61587	244 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	PSG9	Q00887	426 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477		F6UB75	175 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	TOMM40	O96008	361 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	TGFBR1	P36897	503 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF79	Q15937	498 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	TRIM16L	Q309B1	348 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	SP6	Q3SY56	376 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	NPIPB3	Q92617	1050 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	RAB26	Q9ULW5	256 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477		M0QYG6	137 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	NXPH3	O95157	252 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IFT20-216	ENST00000588477	PSG1	P11464	419 aa		10.71	□□□□□ -0.69

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