RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 OR52E5Q8NH55 327 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 C3orf84H3BNL1 204 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 OPRK1P41145 380 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 NPBWR1P48145 328 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 CCR6P51684 374 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00310P59036 64 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 TIGITQ495A1 244 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 NMSQ5H8A3 153 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 ST8SIA2Q92186 375 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SRRQ9GZT4 340 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 RBKSQ9H477 322 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 A0A0B4J2A0 478 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 CLN5O75503 358 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 DFFBO76075 338 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV1-17P01599 117 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 LYL1P12980 280 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 HTR2BP41595 481 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 C2orf83Q53S99 150 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 LGI3Q8N145 548 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 OR4X1Q8NH49 305 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 IL22RA2Q969J5 263 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 CORTO00230 105 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 TNFRSF9Q07011 255 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 PPP1R1AQ13522 171 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SMCO1Q147U7 214 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 TCF24Q7RTU0 167 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 NPIPB3Q92617 1050 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 VSIRQ9H7M9 311 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 RYR2Q92736 4967 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 PITX3O75364 302 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SFT2D2O95562 160 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 IFNA10P01566 189 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 HOXB5P09067 269 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 ANXA3P12429 323 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 NPPCP23582 126 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 RND2P52198 227 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 AP3S2P59780 193 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 OR1S1Q8NH92 325 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 DTD1Q8TEA8 209 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 CDIP1Q9H305 208 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 MPTX1A8MV57 137 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 IGLC1P0CG04 106 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 IAPPP10997 89 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 NPY1RP25929 384 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 CRYBB3P26998 211 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 ACY3Q96HD9 319 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 GINS3Q9BRX5 216 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 C9orf170A2RU37 121 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 OR4C46A6NHA9 309 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 PLA2G10O15496 165 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 OR10J1P30954 320 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 BTCP35070 178 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 LEMD1Q68G75 181 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 LRTM2Q8N967 370 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 Q8WTZ3 238 aa7.15□□□□□ -1.26
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