RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 Q8N1Y9 231 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 DERL3Q96Q80 235 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 IMMP2LQ96T52 175 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RNF5Q99942 180 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 AGMATQ9BSE5 352 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SPXQ9BT56 116 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.46□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 A0A087WW49 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TMEM235A6NFC5 223 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 H0YJW9 148 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RRHO14718 337 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SAP30O75446 220 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 BRI3O95415 125 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 IGLV1-51P01701 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 MAS1P04201 325 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 AKAIN1P0CW23 69 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 CT45A6P0DMU7 189 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 CT45A5P0DMU8 189 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 CT45A7P0DMV0 189 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 CELP19835 753 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SLURP1P55000 103 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 DOC2BQ14184 412 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ARL6IP1Q15041 203 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OR1P1Q8NH06 330 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ARPC1AQ92747 370 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TMEM56Q96MV1 263 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 AQP10Q96PS8 301 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OR5B12Q96R08 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 NMES1Q9C002 83 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 BANF2Q9H503 90 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 WFDC1Q9HC57 220 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 KIAA1456Q9P272 454 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RNF24Q9Y225 148 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.45□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 JTBO76095 146 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 AMBPP02760 352 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RND2P52198 227 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 MEF2DQ14814 521 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ELOBQ15370 118 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ECSCRQ19T08 205 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RNF151Q2KHN1 245 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 GALMQ96C23 342 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TM2D1Q9BX74 207 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 HRH4Q9H3N8 390 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RBKSQ9H477 322 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ZMAT4Q9H898 229 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.44□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 A0A0B4J2A0 478 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 H3BUA1 57 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RAB27BO00194 218 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 FCN1O00602 326 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RAB29O14966 203 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 PROP1O75360 226 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SCGB1D2O95969 90 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TRGC1P0CF51 173 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 QRFPP83859 136 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 RHOGP84095 191 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 PRR27Q6MZM9 219 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OR52I2Q8NH67 350 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 OR4S2Q8NH73 311 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 TMED6Q8WW62 240 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 PTX4Q96A99 478 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ISOC2Q96AB3 205 aa6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PALB2-202ENST00000561514 ATP6V0BQ99437 205 aa6.43□□□□□ -1.38
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