RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560311.1

IRF9-208, Transcript of interferon regulatory factor 9, human

TSL 2

Gene IRF9, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	GNG7	O60262	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	YIF1A	O95070	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	CTSG	P08311	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ANXA3	P12429	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	AKR1C4	P17516	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OPRK1	P41145	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ETV6	P41212	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SPCS3	P61009	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SRPX	P78539	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM187	Q14656	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ODF1	Q14990	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TXN2	Q99757	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311		A0A0B4J2A0	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311		K7EMT4	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TSPAN4	O14817	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	HTR2B	P41595	481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	NPBWR1	P48145	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	RNF2	Q99496	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311		A0A1B0GU03	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	CHEK1	O14757	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	CLN5	O75503	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	S100A6	P06703	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	NPY1R	P25929	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	CCR6	P51684	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	FHL2	Q14192	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	LGI3	Q8N145	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRF9-208	ENST00000560311	TNC	P24821	2201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRF9-208	ENST00000560311	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRF9-208	ENST00000560311	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IRF9-208	ENST00000560311	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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