RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 Q8N9W7 124 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 STAG3L4Q8TBR4 150 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SLC25A46Q96AG3 418 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 OR4C12Q96R67 309 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZNF586Q9NXT0 402 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 HCFC1P51610 2035 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 CUL7Q14999 1698 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 A0A0D9SEW6 157 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 LEPROTO15243 131 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 HIST1H2BKO60814 126 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZNF432O94892 652 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SOD1P00441 154 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 IGHV1-46P01743 117 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 HIST1H2BJP06899 126 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 CXCL1P09341 107 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SLC25A16P16260 332 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ARPP19P56211 112 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 FXYD7P58549 80 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 TSPEAR-AS2P59090 65 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 GNB2P62879 340 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 QRFPP83859 136 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 PLGLB1Q02325 96 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 CCSMST1Q4G0I0 132 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 LCN15Q6UWW0 184 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZNF767PQ75MW2 155 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 APCDD1LQ8NCL9 501 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 OR5D14Q8NGL3 314 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 NAT14Q8WUY8 206 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 OSTCQ9NRP0 149 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZNF835Q9Y2P0 537 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 MYOM2P54296 1465 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ABCC10Q5T3U5 1492 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 OBSL1O75147 1896 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 EML6Q6ZMW3 1958 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SIPA1L1O43166 1804 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 DSCAMO60469 2012 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ARHGAP23Q9P227 1491 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 TRAV27A0A087WT01 109 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 CDC42EP2O14613 210 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 CCL25O15444 150 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SLC25A20O43772 301 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 TPPP2P59282 170 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 MYL5Q02045 173 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SYCNQ0VAF6 134 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 UBE2SQ16763 222 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 C10orf91Q5T1B1 145 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 NCMAPQ5T1S8 102 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 C22orf39Q6P5X5 142 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SNX29P2Q8IUI4 249 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZNF101Q8IZC7 436 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 OR5D16Q8NGK9 328 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 LINC01560Q8TB33 94 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 WFDC5Q8TCV5 224 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 VGLL1Q99990 258 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 C11orf1Q9H5F2 150 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZNF222Q9UK12 451 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 LINC00588Q9Y4M8 146 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 PCM1Q15154 2024 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 BRWD3Q6RI45 1802 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 SYNJ1O43426 1573 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-232ENST00000552331 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms