RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 GLI4P10075 376 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CXCL5P42830 114 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CCL8P80075 99 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFB4O95168 129 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CTLA4P16410 223 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM50BP56557 158 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 HERVK_113P63121 156 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MMD2Q8IY49 270 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 AQP3Q92482 292 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IKZF5Q9H5V7 419 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PAGE4O60829 102 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IGHG4P01861 327 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CSN3P07498 182 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 REG1BP48304 166 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 BSPH1Q075Z2 132 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MLST8Q9BVC4 326 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LILRA1O75019 489 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 Q0VG73 95 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 AICDAQ9GZX7 198 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 OOSP1A8MZH6 123 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C18orf15Q96N68 181 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CGB1A6NKQ9 187 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf100A8MU93 164 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SYNJ2BPP57105 145 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ICAM4Q14773 271 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MDS2Q8NDY4 140 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A22Q9H936 323 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GTL3 188 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 M0R3E3 92 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CRYGSP22914 178 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 BTCP35070 178 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CDKN1AP38936 164 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 OPRK1P41145 380 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MFAP2P55001 183 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CD69Q07108 199 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FOXI1Q12951 378 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ATXN8Q156A1 80 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ECSCRQ19T08 205 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZVH6 145 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IQCF6A8MYZ5 107 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 H3BMG7 143 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 EFNB2P52799 333 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01559Q495D7 138 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RNF144BQ7Z419 303 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 Q96MF0 132 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TCF19Q9Y242 345 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TET1Q8NFU7 2136 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 H3BMM0 161 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00694P0DN24 101 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CD33P20138 364 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZWC4 215 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms