RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SLC51BQ86UW2 128 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 NPIPB3Q92617 1050 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ACY3Q96HD9 319 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 MBP02144 154 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 CLEC3BP05452 202 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 OR10J1P30954 320 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ARL3P36405 182 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 CAMLGP49069 296 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RIPPLY3P57055 190 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SERF2P84101 59 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ARL16Q0P5N6 197 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 OPCMLQ14982 345 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 AWAT1Q58HT5 328 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 BTNL8Q6UX41 500 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 Q6ZRG5 221 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 STOML3Q8TAV4 291 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 Q8WTZ3 238 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 KLK15Q9H2R5 256 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 NUDT19A8MXV4 375 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TGOLN2O43493 480 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 IGLC1P0CG04 106 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RD3LP0DJH9 198 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 FGF7P21781 194 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 BAP18Q8IXM2 172 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 DPF1Q92782 380 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 GINS3Q9BRX5 216 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ARV1Q9H2C2 271 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ATRQ13535 2644 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR2T8A6NH00 312 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 UMAD1C9J7I0 102 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 NDUFA4O00483 81 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 AGPAT2O15120 278 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 TOMM40O96008 361 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 CTSGP08311 255 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 SEC11BP0C7V7 166 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 GPR183P32249 361 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 ZNF616Q08AN1 781 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 MLANAQ16655 118 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 GPHB5Q86YW7 130 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 CCDC140Q96MF4 163 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 PFDN5Q99471 154 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 RNF2Q99496 336 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 LINC01619G3V211 115 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 I3L521 148 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 BMPR1BO00238 502 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR2C1O95371 312 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 TSPAN15O95858 294 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 IGHV3-11P01762 117 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 CD28P10747 220 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 BMI1P35226 326 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 RAB5CP51148 216 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 PLP1P60201 277 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 RPEL1Q2QD12 228 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.2□□□□□ -1.26
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