RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544805.1

RNF10-222, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 2

Gene RNF10, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-222	ENST00000544805	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	OR2T33	Q8NG76	320 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	C9orf85	Q96MD7	179 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	ST20	Q9HBF5	79 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	CACNA1D	Q01668	2161 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	MED12	Q93074	2177 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805		A0A0U1RQV1	116 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	C11orf98	E9PRG8	122 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM250	H0YL14	139 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	DPM2	O94777	84 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	HRAS	P01112	189 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	KRAS	P01116	189 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	OR5AL1	P0C617	328 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	SLC25A4	P12235	298 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	GPR183	P32249	361 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	RND2	P52198	227 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	ADAM8	P78325	824 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	PMAIP1	Q13794	54 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	CR1L	Q2VPA4	569 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805		Q6AWC8	147 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805		Q6ZUT4	128 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	FOXC2	Q99958	501 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	TM2D2	Q9BX73	214 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	AK3	Q9UIJ7	227 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	NSG2	Q9Y328	171 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805		X6R8D5	127 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	CACNA1C	Q13936	2221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	UBL3	O95164	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	FCGR3A	P08637	254 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	IGLC6	P0CF74	106 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	EDNRA	P25101	427 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	SELENOP	P49908	381 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	BSPH1	Q075Z2	132 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	HES1	Q14469	280 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	PMCHL1	Q16048	86 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM54	Q969K7	222 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	PARP11	Q9NR21	331 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	MED12L	Q86YW9	2145 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	OR2T8	A6NH00	312 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805		H3BRM9	83 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	FXYD1	O00168	92 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	SH2D1B	O14796	132 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	GAST	P01350	101 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	FAM236C	P0DP71	79 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	COX5A	P20674	150 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	PPP1CB	P62140	327 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805		Q0VG73	95 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	SPATA45	Q537H7	98 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	TEX45	Q8NA69	505 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	OR4A5	Q8NH83	315 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	JPT2	Q9H910	190 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805		Q9UF83	564 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	VCY	O14598	125 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	OVOL1	O14753	267 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF10-222	ENST00000544805	PLPP2	O43688	288 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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