RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SMCO1Q147U7 214 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 USMG5Q96IX5 58 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC35E1Q96K37 410 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0G2JRQ6 117 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 HELTA6NFD8 242 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 C15orf61A6NNL5 157 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 NPY1RP25929 384 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB11AP62491 216 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SRPXP78539 464 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 DHRS2Q13268 280 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 OR4A5Q8NH83 315 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PRSS46E5RG02 174 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 CD74P04233 296 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 GP9P14770 177 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 LYZP61626 148 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 Q6ZRM9 215 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 Q8N2B8 174 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 IGKV1-39P01597 117 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 IGKV1D-39P04432 117 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 OR5G3P0C626 314 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ORM2P19652 201 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 MAS1LP35410 378 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 CST7O76096 145 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 IGKV3-20P01619 116 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 IL5P05113 134 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SPNP16150 400 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 GOSR2O14653 212 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RLN2P04090 185 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 FOLR2P14207 255 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 UCP1P25874 307 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SPCS3P61009 180 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ATG101Q9BSB4 218 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 DNHD1Q96M86 4753 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0B4J2A0 478 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 C9orf170A2RU37 121 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 TEX46H3BTG2 121 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SFT2D2O95562 160 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 STHQ8IWL8 128 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00052Q96N35 136 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 GINS3Q9BRX5 216 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PSENENQ9NZ42 101 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM223BA6NKX1 122 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 MED6O75586 246 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFB6O95139 128 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 CDS2O95674 445 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 CTRB1P17538 263 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 CD81P60033 236 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3P1-201ENST00000514813 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.02□□□□□ -1.61
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