RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 ETV7Q9Y603 341 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-222ENST00000514552 K7EMT4 169 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TGOLN2O43493 480 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CDK2AP2O75956 126 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CD5P06127 495 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 SERPINE2P07093 398 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 GPR183P32249 361 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CBX5P45973 191 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM187Q14656 261 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 PLET1Q6UQ28 207 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 C19orf35Q6ZS72 473 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 LYG2Q86SG7 212 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 HOGA1Q86XE5 327 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 GIMAP1Q8WWP7 306 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 GALNT14Q96FL9 552 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CACNG5Q9UF02 275 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 RAB26Q9ULW5 256 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 HERC2O95714 4834 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 PKHD1P08F94 4074 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 A0A0J9YWU9 116 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 UPK2O00526 184 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 LY6G6CO95867 125 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 IGHV3-23P01764 117 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 FCGR2CP31995 323 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TCTAP57738 103 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 ERVK-16P61578 105 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 FCN2Q15485 313 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 DEFB135Q30KP9 77 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 IZUMO2Q6UXV1 221 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 SSX9Q7RTT3 188 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 OR5B3Q8NH48 314 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A38Q96DW6 304 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TSC22D3Q99576 134 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 MFFQ9GZY8 342 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 J3QRK9 145 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TNFSF12O43508 249 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 REG1AP05451 166 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 F2RP25116 425 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 WT1-ASQ06250 92 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 C14orf177Q52M58 125 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF773Q6PK81 442 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 OR1P1Q8NH06 330 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 OR10C1Q96KK4 312 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CNBD2Q96M20 576 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM56Q96MV1 263 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TXN2Q99757 166 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 AUNIPQ9H7T9 357 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 PRNDQ9UKY0 176 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 SSR3Q9UNL2 185 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 S4R3C0 116 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 OR2T8A6NH00 312 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 K7EIM0 57 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 SULT1C2O00338 296 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 S1PR2O95136 353 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 OR13C7P0DN81 318 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 PSMB9P28065 219 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 GNRHRP30968 328 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 SDC2P34741 201 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TAS2R46P59540 309 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 AADACL3Q5VUY0 350 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 DHRS11Q6UWP2 260 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM17Q86X19 198 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 CMTM1Q8IZ96 169 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-222ENST00000514552 GVQW1Q8N7I0 195 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms