RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HTR2BP41595 481 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HBG1P69891 147 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HBG2P69892 147 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PRCDQ00LT1 54 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 BAXQ07812 192 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 GAGE2BQ13066 116 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IL15RAQ13261 267 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 AARDQ4LEZ3 155 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 GAGE2EQ4V326 116 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TMEM86BQ8N661 226 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 Q8N6K4 173 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ZNF114Q8NC26 417 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 C17orf50Q8WW18 174 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 FBXL15Q9H469 300 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 RBKSQ9H477 322 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TCF19Q9Y242 345 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 A6NDX4 124 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ARPC5O15511 151 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CA2P00918 260 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HLA-DRB1P01911 266 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CRYGBP07316 175 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR8U8P0C7N1 319 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IAPPP10997 89 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PAX6P26367 422 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ZNF345Q14585 488 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 FXYD3Q14802 87 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 LY6EQ16553 131 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 C22orf15Q8WYQ4 148 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 AQP10Q96PS8 301 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 RNF126Q9BV68 326 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CORTO00230 105 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DFFBO76075 338 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OPN1MWP04001 364 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IFNA4P05014 189 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR13C7P0DN81 318 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 DEFA4P12838 97 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CNTFRP26992 372 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 S100A11P31949 105 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 IER3P46695 156 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CD300CQ08708 224 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ATP6V1FQ16864 119 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 Q5BKY6 102 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 Q8N9W7 124 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ARPC1AQ92747 370 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 GON7Q9BXV9 100 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 ARL6Q9H0F7 186 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 THYN1Q9P016 225 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HSPB11Q9Y547 144 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 MSGN1A6NI15 193 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 FCN1O00602 326 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 SCGB2A1O75556 95 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 IFNA5P01569 189 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 IGHV4-59P01825 116 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 CRYBA1P05813 215 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 NPY1RP25929 384 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 SULT1A1P50225 295 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 CX3CL1P78423 397 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 ZNF266Q14584 549 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 SPINK9Q5DT21 86 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 TMUB2Q71RG4 321 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 TMEM219Q86XT9 240 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-210ENST00000512194 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms