RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-208ENST00000512153 ATP5G1P05496 136 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ATP5G3P48201 142 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 DEFB1P60022 68 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 OR4X1Q8NH49 305 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ZNF503Q96F45 646 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 UHRF2Q96PU4 802 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 MGLLQ99685 303 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 Q9H3A6 140 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ENY2Q9NPA8 101 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 C8orf4Q9NR00 106 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 EHFQ9NZC4 300 aa7.42□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 A0A1W2PPQ1 181 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ICAM4Q14773 271 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 MLANAQ16655 118 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ZNF709Q8N972 641 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 RNF141Q8WVD5 230 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 U3KQE9 123 aa7.41□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 GPR31O00270 319 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 IGKV1-17P01599 117 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 IL4P05112 153 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 RORCP51449 518 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 ERVFC1-1P60608 527 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 DHODHQ02127 395 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 OR5I1Q13606 314 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 FCN2Q15485 313 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 FAM78BQ5VT40 261 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 IFT46Q9NQC8 304 aa7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
COPB2-208ENST00000512153 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 CBY3A6NI87 242 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 RGS10O43665 173 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 CBX5P45973 191 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 RFX2P48378 723 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 C22orf42Q6IC83 251 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 SEC22AQ96IW7 307 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 ABHD1Q96SE0 405 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 KLK11Q9UBX7 282 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 NOTOA8MTQ0 251 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 BUB3O43684 328 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 PRM2P04554 102 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 OR10J1P30954 320 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 ETV6P41212 452 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 LINC00315P59091 139 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 KRTAP10-1P60331 282 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 FCGR1BQ92637 280 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.38□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 F6UB75 175 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 EBAG9O00559 213 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 PMP2P02689 132 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 RD3LP0DJH9 198 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 PSMB3P49720 205 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 RND2P52198 227 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 ZNF79Q15937 498 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 DIABLOQ9NR28 239 aa7.37□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.36□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 A0A0J9YY99 117 aa7.36□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.36□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 IGLC1P0CG04 106 aa7.36□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 HTN1P15515 57 aa7.36□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 GCSHP23434 173 aa7.36□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 HSPA13P48723 471 aa7.36□□□□□ -1.23
COPB2-208ENST00000512153 TAS2R20P59543 309 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms