RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CST9LP1Q5W188 147 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf52Q96A22 123 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MISP3Q96FF7 219 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXC2Q99958 501 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MLXQ9UH92 298 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CLDN34H7C241 214 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-48P01763 117 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CXCL1P09341 107 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CD24P25063 80 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PLP1P60201 277 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PAX8Q06710 450 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 FXYD3Q14802 87 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MORN5Q5VZ52 161 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C1QL4Q86Z23 238 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PRELID1Q9Y255 219 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EIM0 57 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFS8O00217 210 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFB4O95168 129 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 APELAP0DMC3 54 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PAX1P15863 534 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 LGALS4P56470 323 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS2R45P59539 299 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PLGLAQ15195 96 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4X1Q8NH49 305 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8WTZ3 238 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PFDN5Q99471 154 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CCL19Q99731 98 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SSX3Q99909 188 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFHX3Q15911 3703 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PRE2 83 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 COX7A2P2O60397 106 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CNIH1O95406 144 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB5BP61020 215 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CX3CL1P78423 397 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ADIRFQ15847 76 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 KLK9Q2XQG4 91 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01551Q86U37 167 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM168AQ92567 244 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SMR3AQ99954 134 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 NPFFO15130 113 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 PLXNB1O43157 2135 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLC1P0CG04 106 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 BPIFB3P59826 476 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 NDPQ00604 133 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 HES1Q14469 280 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8N9W7 124 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 UHRF2Q96PU4 802 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 DERL1Q9BUN8 251 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 BIN3Q9NQY0 253 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 C9JCJ5 164 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM106CPP0CH98 169 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM11P17152 192 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 SAA4P35542 130 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 SMUG1Q53HV7 270 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP82Q8N141 532 aa8.51□□□□□ -1.05
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