RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 PPP5D1E7EU14 171 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 ST8SIA3O43173 380 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 CDS2O95674 445 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 IGHV3-48P01763 117 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 DEFA4P12838 97 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 PSMB6P28072 239 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 CD40LGP29965 261 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 MAS1LP35410 378 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 MFAP2P55001 183 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 PPP1R1AQ13522 171 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 CST9LP1Q5W188 147 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 SLC35G3Q8N808 338 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 P2RX4Q99571 388 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 C15orf61A6NNL5 157 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 UBE2CO00762 179 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 LYRM1O43325 122 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 NDUFB6O95139 128 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 IFNA17P01571 189 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 IGKV3-20P01619 116 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 P0C879 139 aa5.65□□□□□ -1.5
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UBE2B-204ENST00000504431 MYCNOSP40205 109 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 DHODHQ02127 395 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 ATP5G2Q06055 141 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF846Q147U1 533 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 C15orf32Q32M92 178 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 S100ZQ8WXG8 99 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 DCUN1D4Q92564 292 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 CACNG5Q9UF02 275 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 PRNDQ9UKY0 176 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-204ENST00000504431 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 CENPXA8MT69 81 aa5.64□□□□□ -1.51
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UBE2B-204ENST00000504431 SFT2D2O95562 160 aa5.64□□□□□ -1.51
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UBE2B-204ENST00000504431 DEFA6Q01524 100 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF616Q08AN1 781 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.64□□□□□ -1.51
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UBE2B-204ENST00000504431 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.64□□□□□ -1.51
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UBE2B-204ENST00000504431 TMEM56Q96MV1 263 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 C9orf170A2RU37 121 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 MPTX1A8MV57 137 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 LINC01619G3V211 115 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 H3BUA1 57 aa5.63□□□□□ -1.51
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UBE2B-204ENST00000504431 UPK1BO75841 260 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 TSHBP01222 138 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 TCRBP04435 133 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 OR4E1P0C645 316 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 SYNJ2BPP57105 145 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 PRCDQ00LT1 54 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF343Q6P1L6 599 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 LGI3Q8N145 548 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 NECAP1Q8NC96 275 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-204ENST00000504431 GALNT14Q96FL9 552 aa5.63□□□□□ -1.51
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