RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574		A0A0G2JLM5	398 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CD5L	O43866	347 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	NUP35	Q8NFH5	326 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS2	P07478	247 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	TM4SF5	O14894	197 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFS8	O00217	210 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	GLRX	P35754	106 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	LHX2	P50458	406 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	GFRA3	O60609	400 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PRR31	Q5SQ13	230 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	SNCG	O76070	127 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	KLK10	O43240	276 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	GGN	Q86UU5	652 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CACNA1H	O95180	2353 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	GUSBP1	Q15486	140 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00473	A8K010	186 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	STPG4	Q8N801	248 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF479	Q96JC4	524 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574		Q6P435	159 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	COQ2	Q96H96	371 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	APOM	O95445	188 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	LEP	P41159	167 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	F2RL2	O00254	374 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	DLX6	P56179	175 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00205	P59089	165 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	MMP23A	O75900	390 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	ESD	P10768	282 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	ERVK11-1	P61568	191 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	DPM2	O94777	84 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1-39	P01597	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1D-39	P04432	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	METTL26	Q96S19	204 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	RAB9A	P51151	201 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	VCX2	Q9H322	139 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54

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