RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H3AP68431 136 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 H3F3AP84243 136 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 SPANXN3Q5MJ09 141 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PIEZO1Q92508 2521 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 EYSQ5T1H1 3165 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 KIF13BQ9NQT8 1826 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRL2O95490 1459 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-7P63135 1459 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 EEA1Q15075 1411 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 NUMA1Q14980 2115 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 DPRXA6NFQ7 191 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA10P01566 189 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TRGC1P0CF51 173 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 REEP5Q00765 189 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM6Q96B49 74 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 CST9LQ9H4G1 147 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK5Q9H7D0 1870 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3C2BO00750 1634 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PAPPAQ13219 1627 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TRPM2O94759 1503 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PXDNQ92626 1479 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TECPR2O15040 1411 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 OVOS2Q6IE36 1432 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 QSER1Q2KHR3 1735 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 FADS1O60427 444 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 CNIH1O95406 144 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 AQP4P55087 323 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 CDK10Q15131 360 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 OR6V1Q8N148 313 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PRO3102Q9H379 93 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 NRXN1Q9ULB1 1477 aa3.03□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZFYVE9O95405 1425 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ERBINQ96RT1 1412 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 F8W036 122 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 PIRO00625 290 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 HAND1O96004 215 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-5P01602 117 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 BRCA2P51587 3418 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 RTTNQ86VV8 2226 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ORC5O43913 435 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA6P05013 189 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ERVS71-1P61550 626 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 COA5Q86WW8 74 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 DUOX2Q9NRD8 1548 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF5Q12774 1597 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 LAMB2P55268 1798 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 PEAK1Q9H792 1746 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF737O75373 536 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 RBP1P09455 135 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 FAM236CP0DP71 79 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 CT55Q8WUE5 264 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 SBF1O95248 1867 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 TRANK1O15050 2925 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 hADV38S2A0JD32 116 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 CIAO1O76071 339 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms