RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CLINT1Q14677 625 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 TREML4Q6UXN2 200 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CLEC19AQ6UXS0 136 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 GNB4Q9HAV0 340 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ZFP92A6NM28 416 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 BCL2L11O43521 198 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-11P01762 117 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CTSGP08311 255 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ZP3P21754 424 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ARL3P36405 182 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 DEFA5Q01523 94 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 MLANAQ16655 118 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 C3orf56Q8N813 242 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ARL6Q9H0F7 186 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 NF1P21359 2839 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OR2T8A6NH00 312 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 C17orf112F2Z3M2 114 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CXCL2P19875 107 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP10-3P60369 221 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ZNF616Q08AN1 781 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 BTNL8Q6UX41 500 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 TMUB2Q71RG4 321 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 DPF1Q92782 380 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 LINC01619G3V211 115 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 TOMM40O96008 361 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1-17P01599 117 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-48P01763 117 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-23P01764 117 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 FGF7P21781 194 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CAMLGP49069 296 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 FHL3Q13643 280 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 GPHB5Q86YW7 130 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ZNF709Q8N972 641 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OR4F4Q96R69 305 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 SMIM3Q9BZL3 60 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 S4R3C0 116 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ATRQ13535 2644 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD34BA5PLL1 514 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 BMPR1BO00238 502 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 NDUFA4O00483 81 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 S100A7P31151 101 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ADMP35318 185 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 MYCNOSP40205 109 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 RPEL1Q2QD12 228 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 FAM106AQ4KMX7 169 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 S100A7AQ86SG5 101 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 BPIFCQ8NFQ6 507 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OR11H1Q8NG94 326 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OR1N2Q8NGR9 330 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 Q8WTZ3 238 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 MGST2Q99735 147 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CHRDL1Q9BU40 450 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 WFDC1Q9HC57 220 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 PPP5D1E7EU14 171 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CCL24O00175 119 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 LGALS9O00182 355 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 AGPAT2O15120 278 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OR2C1O95371 312 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 RD3LP0DJH9 198 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OPCMLQ14982 345 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 TIGITQ495A1 244 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 SLC51BQ86UW2 128 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 STOML3Q8TAV4 291 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 OR5B12Q96R08 314 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 ARV1Q9H2C2 271 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms