RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481116.5

ABCF3-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 3, humanhuman

TSL 4

Gene ABCF3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3-215ENST00000481116 OR4C46A6NHA9 309 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 IGLC1P0CG04 106 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 IL7P13232 177 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 NPPCP23582 126 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 OR10J1P30954 320 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 BTCP35070 178 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 CASC10Q5T4H9 136 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 LRTM2Q8N967 370 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 NPIPB3Q92617 1050 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 U3KQ87 197 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 AGRNO00468 2067 aa9.55□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 C9orf170A2RU37 121 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 ADAP1O75689 374 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 NDUFB6O95139 128 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 SLC25A4P12235 298 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 LYL1P12980 280 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.54□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 MPTX1A8MV57 137 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 IFNA4P05014 189 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 CRYBB3P26998 211 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 NOXA1Q86UR1 476 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 METTL26Q96S19 204 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.53□□□□□ -0.88
ABCF3-215ENST00000481116 A6NHS1 94 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 WRBO00258 174 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 PLA2G10O15496 165 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 SCGB2A1O75556 95 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 OR4E1P0C645 316 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 SLC25A6P12236 298 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 BMI1P35226 326 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 Q8WTZ3 238 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.52□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 A0A1W2PS18 150 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 CENPXA8MT69 81 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 IL4P05112 153 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 P2RY1P47900 373 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 PAFAH1B2P68402 229 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 DHRS2Q13268 280 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 GAMTQ14353 236 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 DEFB135Q30KP9 77 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 LYG2Q86SG7 212 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 RABAC1Q9UI14 185 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 U3KQE9 123 aa9.51□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 SYNGR2O43760 224 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 MED6O75586 246 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 TOMM40O96008 361 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 RD3LP0DJH9 198 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 PSG1P11464 419 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 APOC4P55056 127 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 DEFB131AP59861 70 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 ZNF90Q03938 601 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 C4orf46Q504U0 113 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 LEMD1Q68G75 181 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 RYR3Q15413 4870 aa9.5□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 ZFP92A6NM28 416 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 H3BP45 60 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 LYRM1O43325 122 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 CD5P06127 495 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 RAB11AP62491 216 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 STPG3Q8N7X2 389 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 COQ8AQ8NI60 647 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 SLC35E1Q96K37 410 aa9.49□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.48□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 K7EQG2 157 aa9.48□□□□□ -0.89
ABCF3-215ENST00000481116 SPRY2O43597 315 aa9.48□□□□□ -0.89
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