RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 TMEM250H0YL14 139 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 LEPP41159 167 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.617e-6■■■■□ 19.5
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NISCH-207ENST00000479054 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.22□□□□□ -0.61
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NISCH-207ENST00000479054 H3BUX3 64 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 SMIM13P0DJ93 91 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 Q6P435 159 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 SERF1AO75920 110 aa11.22□□□□□ -0.61
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