RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 STAG3L3P0CL85 134 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 FABP4P15090 132 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 POU2AF1Q16633 256 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 SLC25A17O43808 307 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 NECAP1Q8NC96 275 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 OR1P1Q8NH06 330 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 MGST2Q99735 147 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 RRHO14718 337 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 NPPCP23582 126 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 GNB1P62873 340 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 HES1Q14469 280 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 FAM209BQ5JX69 171 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 LINC01551Q86U37 167 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 OR5R1Q8NH85 324 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 ENY2Q9NPA8 101 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 RAB31Q13636 194 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PPQ1 181 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 MT-CO2P00403 227 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 CST9LP1Q5W188 147 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 J3QLI3 93 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 NPY1RP25929 384 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ATP5G3P48201 142 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ACANP16112 2415 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 E7EUB6 86 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 UPK2O00526 184 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 RHOBP62745 196 aa14.81□□□□□ -0.04
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CAPN3-209ENST00000466222 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 TEPPQ6URK8 271 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 FBXL15Q9H469 300 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 PRNDQ9UKY0 176 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 CR1P17927 2039 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 OOSP1A8MZH6 123 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 MOSP00540 346 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 FOXL1Q12952 345 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 MIC13Q5XKP0 118 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 SMR3AQ99954 134 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 BET1LQ9NYM9 111 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 CUBNO60494 3623 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 XKRY2A2RUG3 117 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 FCN1O00602 326 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 NDUFB4O95168 129 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 LGALS7P47929 136 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 UBE2G2P60604 165 aa14.8□□□□□ -0.04
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CAPN3-209ENST00000466222 MMDQ15546 238 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 PIFOQ8TCI5 191 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ABCA1O95477 2261 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 CRYGBP07316 175 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 DEFA4P12838 97 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 HINT2Q9BX68 163 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 TSTD3H0UI37 97 aa14.78□□□□□ -0.04
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