RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466165.1

PRKRA-208, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, human

TSL 2

Gene PRKRA, Length 585 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKRA-208	ENST00000466165	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165		M0QYG6	137 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ATP5G1	P05496	136 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	OPRK1	P41145	380 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ATP5G3	P48201	142 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	DEFB1	P60022	68 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SEC22A	Q96IW7	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	FCER2	P06734	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ID1	P41134	155 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	MLANA	Q16655	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165		Q6ZSN1	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	CBY3	A6NI87	242 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	GPR31	O00270	319 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	BUB3	O43684	328 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	RORC	P51449	518 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ICAM4	Q14773	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	EHF	Q9NZC4	300 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	CBX5	P45973	191 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	KRTAP10-1	P60331	282 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	DHODH	Q02127	395 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF79	Q15937	498 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	UPK3B	Q9BT76	320 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	RGS10	O43665	173 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	S100G	P29377	79 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	PSMB3	P49720	205 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	PAX9	P55771	341 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	LINC00315	P59091	139 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	UHRF2	Q96PU4	802 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	ABHD1	Q96SE0	405 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	KLK11	Q9UBX7	282 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	IGKV1-39	P01597	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	IGKV1D-39	P04432	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	IL4	P05112	153 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	RFX2	P48378	723 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	HSPA13	P48723	471 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	B2M	P61769	119 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	FCN2	Q15485	313 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	ENY2	Q9NPA8	101 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165		A0A0A6YYH2	397 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165		A6NJ64	397 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	PRM2	P04554	102 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	TSPO	P30536	169 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	OR10J1	P30954	320 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	ETV6	P41212	452 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	ESRG	Q1W209	222 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165		A0A0J9YX75	114 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PRKRA-208	ENST00000466165		F6UB75	175 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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