RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 H0YJW9 148 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 COL8A2P25067 703 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 EDDM3BP56851 147 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 MTURNQ8N3F0 131 aa6.97□□□□□ -1.29
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LMO3-210ENST00000453727 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 IL36BQ9NZH7 164 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 TENM4Q6N022 2769 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-210ENST00000453727 C7orf71A4D174 169 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 NDUFB4O95168 129 aa6.96□□□□□ -1.3
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LMO3-210ENST00000453727 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 CHODLQ9H9P2 273 aa6.96□□□□□ -1.3
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LMO3-210ENST00000453727 FAM231BA6NCW3 169 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 C15orf65H3BRN8 121 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 SERPINE2P07093 398 aa6.96□□□□□ -1.3
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LMO3-210ENST00000453727 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.96□□□□□ -1.3
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LMO3-210ENST00000453727 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
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LMO3-210ENST00000453727 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.96□□□□□ -1.3
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LMO3-210ENST00000453727 IGKV1-33P01594 117 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.95□□□□□ -1.3
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LMO3-210ENST00000453727 CGB7P0DN87 165 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 NPY1RP25929 384 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 COL8A1P27658 744 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 SRIP30626 198 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 LGALS4P56470 323 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 UBE2G1P62253 170 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 LTC4SQ16873 150 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 ZNF479Q96JC4 524 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 OR4C12Q96R67 309 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 THYN1Q9P016 225 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 CTSZQ9UBR2 303 aa6.94□□□□□ -1.3
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