RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	MLX	Q9UH92	298 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	SSSCA1	O60232	199 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	FABP1	P07148	127 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	GAMT	Q14353	236 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241		A8MZ25	164 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	CCS	O14618	274 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN4	O14817	238 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	TOMM40	O96008	361 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	IL15RA	Q13261	267 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	BTNL8	Q6UX41	500 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241		Q8WTZ3	238 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PS18	150 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF785	A8K8V0	405 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	CHEK1	O14757	476 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	EDN2	P20800	178 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	CRYBB3	P26998	211 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	PAX9	P55771	341 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	THAP8	Q8NA92	274 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	METTL26	Q96S19	204 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	TRGV9	Q99603	122 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	NMES1	Q9C002	83 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	VSIR	Q9H7M9	311 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	C7orf66	A4D0T2	115 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241		K7EPK0	472 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241		L7N2F9	121 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	NPPC	P23582	126 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	VAMP2	P63027	116 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N1Y9	231 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	GGACT	Q9BVM4	153 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP92	A6NM28	416 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241		H3BP45	60 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	DLK1	P80370	383 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		11	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	TG	P01266	2768 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241		U3KQE9	123 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	GOSR2	O14653	212 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	SSNA1	O43805	119 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	IL4	P05112	153 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	10.98	□□□□□ -0.65
PTPA-222	ENST00000445241	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65

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