RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPINK9Q5DT21 86 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DTD1Q8TEA8 209 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C2orf50Q96LR7 162 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MS4A10Q96PG2 267 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 P2RX4Q99571 388 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MFFQ9GZY8 342 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBKSQ9H477 322 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ENY2Q9NPA8 101 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 THYN1Q9P016 225 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.34□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COLCA2A8K830 154 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCSO14618 274 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYNGR2O43760 224 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NXPH3O95157 252 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A4P12235 298 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNCAP37840 140 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MFAP2P55001 183 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C15orf32Q32M92 178 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C2orf83Q53S99 150 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF141Q8WVD5 230 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.33□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STAB1Q9NY15 2570 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C5orf51A6NDU8 294 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 G3V3Q6 166 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 M0QZ24 198 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CORTO00230 105 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GOSR2O14653 212 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BCL2L11O43521 198 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2J3O76001 311 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFB8O95169 186 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H2BFSP57053 126 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAS2R30P59541 319 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP5G2Q06055 141 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR4F4Q96R69 305 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP6V0BQ99437 205 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNB4Q9HAV0 340 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PPQ1 181 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PRX2 142 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 I3L2K1 104 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 K7EIM0 57 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARPC5O15511 151 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM50AO95807 157 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGF7P21781 194 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPY1RP25929 384 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FHL3Q13643 280 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RHEBQ15382 184 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMIM8Q96KF7 97 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC140Q96MF4 163 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB40CQ96S21 281 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NMES1Q9C002 83 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF222A6NCQ9 220 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C15orf62A8K5M9 175 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 K7EPK0 472 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSSCA1O60232 199 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms