RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 IGHG2P01859 326 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 IGF1P05019 195 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00869P0C866 280 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PAX6P26367 422 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 OR10J1P30954 320 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PLP1P60201 277 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF726P1Q15940 193 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 GUK1Q16774 197 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FBLN7Q53RD9 439 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 KHDC3LQ587J8 217 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 TOR2AQ5JU69 321 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MIC13Q5XKP0 118 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 Q6YL49 198 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 S100A7AQ86SG5 101 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 RAB24Q969Q5 203 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ACY3Q96HD9 319 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 VSIRQ9H7M9 311 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MANBALQ9NQG1 85 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 K7EIM0 57 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 CD5LO43866 347 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 CLN5O75503 358 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 CXorf1O96002 111 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 OR5G3P0C626 314 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 STAG3L2P0CL84 134 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 STAG3L3P0CL85 134 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 IER3P46695 156 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 RND2P52198 227 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 MFAP4P55083 255 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TAS2R45P59539 299 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 NDPQ00604 133 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 SCGB2A2Q13296 93 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 MLANAQ16655 118 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM86BQ8N661 226 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 SEC11CQ9BY50 192 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TREM1Q9NP99 234 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM160Q9NX00 188 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.71□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 ATP6V0E1O15342 81 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 AMY1AP04745 511 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 S100A7P31151 101 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 LCN15Q6UWW0 184 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 VAX2Q9UIW0 290 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 RNF24Q9Y225 148 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 FUT9Q9Y231 359 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM89A2RUT3 159 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 FAM223BA6NKX1 122 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 AP4M1O00189 453 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 IGLC1P0CG04 106 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 BCL2P10415 239 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 FAM209BQ5JX69 171 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 NECAP1Q8NC96 275 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A22Q9H936 323 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 ANK2Q01484 3957 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 29.9
POLR1A-202ENST00000409024 CR1P17927 2039 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.68□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.68□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 PSMB11A5LHX3 300 aa7.68□□□□□ -1.18
POLR1A-202ENST00000409024 COX7A2P2O60397 106 aa7.68□□□□□ -1.18
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