RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 S100A4P26447 101 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 HOXA6P31267 233 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPINT3P49223 89 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB5BP61020 215 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM254Q8TBM7 123 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 C14orf132Q9NPU4 83 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 ORMDL1Q9P0S3 153 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 JPT1Q9UK76 154 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 H0Y980 276 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 OCM2P0CE71 109 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCL1AP56279 114 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM9CQ8IZT9 166 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR52R1Q8NGF1 315 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 MED29Q9NX70 200 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 CITO14578 2027 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-38P-201ENST00000384085 C7orf71A4D174 169 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 AHSA1O95433 338 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5G3P0C626 314 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4E1P0C645 316 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 C12orf74Q32Q52 190 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC01554Q52M75 96 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD29Q8N6D5 301 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10AC1Q8NH08 325 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMF1Q92530 271 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 DRC3Q9H069 523 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSTPIP2Q9H939 334 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUPR2A6NF83 97 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRN3E7EW58 273 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF682O95780 498 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDKL4Q5MAI5 379 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 C20orf196Q8IYI0 205 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35B4Q969S0 331 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00052Q96N35 136 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 ECM29Q5VYK3 1845 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC16A4O15374 487 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2J2O76002 312 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRYZL1O95825 349 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHFRP00374 187 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 FXYD6P3P58550 94 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEFA1P59665 94 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPOPLQ6IQ16 392 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2orf82Q6UX34 121 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATOH7Q8N100 152 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR8D4Q8NGM9 314 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCL2L10Q9HD36 194 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBAP1Q9NZ09 502 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 SBF1O95248 1867 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNS3Q68CZ2 1445 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A0A6YYH2 397 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 A6NJ64 397 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 GADD45GO95257 159 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H2BLQ99880 126 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL7A1Q02388 2944 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 HECW1Q76N89 1606 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A087X0T9 212 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 C5orf67F2Z3F1 127 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 H3BRM9 83 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEXIO95424 95 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNNC2P02585 160 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD2P06729 351 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD79AP11912 226 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSME3P61289 254 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 RHOBP62745 196 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 QRFPP83859 136 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR52L1Q8NGH7 329 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2T35Q8NGX2 323 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR52E6Q96RD3 313 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TP53RKQ96S44 253 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPER1Q99527 375 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM138Q9NPI0 162 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 PKIGQ9Y2B9 76 aa-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms