RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 PRR7Q8TB68 274 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 AGMATQ9BSE5 352 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 COX6A1P12074 109 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 DUX5Q96PT3 197 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf172C9J069 976 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRT-204ENST00000373190 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 COX11Q9Y6N1 276 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 ATXN8Q156A1 80 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 CCL1P22362 96 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 SLC25A20O43772 301 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 DEPPQ9NTK1 212 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 A8MWP6 167 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM238C9JI98 176 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 ID3Q02535 119 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 CD69Q07108 199 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 LAGE3Q14657 143 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 ARPC1AQ92747 370 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 WBP1LQ9NX94 342 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 GUSBP1Q15486 140 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 EPDR1Q9UM22 224 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 A0A087X0K7 114 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 M0R2P5 195 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 PSG1P11464 419 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZT83 130 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01551Q86U37 167 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 JMJD8Q96S16 334 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 GREM1O60565 184 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRT-204ENST00000373190 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 NAPSAO96009 420 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 GFI1Q99684 422 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV3-20P01619 116 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00271P0C7V0 271 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 GP6Q9HCN6 339 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 YPEL1O60688 119 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TRGV3P03979 118 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 MESP2Q0VG99 397 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 YPEL2Q96QA6 119 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0G2JMM0 328 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRT-204ENST00000373190 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 F2Z2F3 143 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 ERG28Q9UKR5 140 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 GGTLC3B5MD39 225 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 FBXL15Q9H469 300 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-204ENST00000373190 CTSBP07858 339 aa7.35□□□□□ -1.23
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