RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 CA7P43166 264 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 LOXL3P58215 753 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 SRYQ05066 204 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 PSMG4Q5JS54 123 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 DPF1Q92782 380 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 MBD6Q96DN6 1003 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 NABP2Q9BQ15 211 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 CSTL1Q9H114 145 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TCF19Q9Y242 345 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP13Q12802 2813 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 ACACAQ13085 2346 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 FAM231BA6NCW3 169 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 OR4C46A6NHA9 309 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00473A8K010 186 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 AHRRA9YTQ3 701 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 OR7C2O60412 319 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 DEFA4P12838 97 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 IGLL1P15814 213 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 MFAP2P55001 183 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 FOXF2Q12947 444 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 MAJINQ3KP22 176 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 Q56UQ5 140 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 OR4A47Q6IF82 309 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 DOLPP1Q86YN1 238 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 AP1S3Q96PC3 154 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 PSG11Q9UQ72 335 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 APC2O95996 2303 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 CBY3A6NI87 242 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf70A6NJV1 201 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 LEPROTL1O95214 131 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3-9P01782 118 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TNXAQ16473 311 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 POU2AF1Q16633 256 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf30Q96GV9 206 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 GNG12Q9UBI6 72 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 RNF114Q9Y508 228 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 MED12Q93074 2177 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC13O75165 2243 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 F5H697 171 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFS8O00217 210 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 SMPD2O60906 423 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 CEACAM3P40198 252 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 HBBP68871 147 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 AESQ08117 197 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 SPINK9Q5DT21 86 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 PERPQ96FX8 193 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 GTF3C1Q12789 2109 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE12BA1L429 117 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 A6NDN8 102 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 A8MWL6 223 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TAX1BP3O14907 124 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TCL1AP56279 114 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 SLAQ13239 276 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 FXYD3Q14802 87 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 MLANAQ16655 118 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 TCF24Q7RTU0 167 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 WDR86Q86TI4 376 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 NUP35Q8NFH5 326 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 FAM168AQ92567 244 aa5.84□□□□□ -1.47
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