RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 PAXXQ9BUH6 204 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 TPPP3Q9BW30 176 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 F6UZH7 168 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 PF4V1P10720 104 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 RNF212Q495C1 297 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 C2orf83Q53S99 150 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 THYN1Q9P016 225 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 ZANQ9Y493 2812 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 CRYBA1P05813 215 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 GPR183P32249 361 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 ERVFC1-1P60608 527 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 LMO4P61968 165 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP10-9P60411 292 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 UBE2G1P62253 170 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 MANBALQ9NQG1 85 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 IGLV2-23P01705 113 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 C8orf88P0DMB2 117 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 ZNF329Q86UD4 541 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 GGACTQ9BVM4 153 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 FUT9Q9Y231 359 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 TMEM68Q96MH6 324 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 TBX15Q96SF7 602 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 ASCL2Q99929 193 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 PGPA6NDG6 321 aa9.27□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 MSMBP08118 114 aa9.27□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 PSG1P11464 419 aa9.27□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 POU2AF1Q16633 256 aa9.27□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.27□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 MARVELD3Q96A59 401 aa9.27□□□□□ -0.92
HPS1-204ENST00000361490 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 NDUFA6P56556 154 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 CD81P60033 236 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 OR5I1Q13606 314 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 OR4A5Q8NH83 315 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 PFDN5Q99471 154 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 NAT8Q9UHE5 227 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 HELTA6NFD8 242 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 CGB1A6NKQ9 187 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 GNG4P50150 75 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 UBE2E1P51965 193 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 GNG5P63218 68 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 MORN5Q5VZ52 161 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 Q8WTZ3 238 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 LINC00479Q96M42 142 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 SCGB2A1O75556 95 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 PRR31Q5SQ13 230 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 OR51M1Q9H341 326 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 B4DSR2 109 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 CLDN34H7C241 214 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 CLN5O75503 358 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 AMY1AP04745 511 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 MALSU1Q96EH3 234 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 BIN3Q9NQY0 253 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 ITPR3Q14573 2671 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 A0A1B0GW64 132 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 ZNF785A8K8V0 405 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 FBLN7Q53RD9 439 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 Q5PR19 223 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 OR1P1Q8NH06 330 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-204ENST00000361490 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms