RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ST8SIA2Q92186 375 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 NPIPB3Q92617 1050 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 ACY3Q96HD9 319 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 GINS3Q9BRX5 216 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 NUDT15Q9NV35 164 aa11.16□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 WRBO00258 174 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 SYNGR2O43760 224 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 IFNA4P05014 189 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 IFITM3Q01628 133 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF846Q147U1 533 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 HAGHQ16775 308 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 MITD1Q8WV92 249 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 BATF3Q9NR55 127 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.15□□□□□ -0.62
CSAG1-201ENST00000361211 TENM3Q9P273 2699 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 MED6O75586 246 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 UPK1BO75841 260 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ASAH1Q13510 395 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A2PQ658T7 463 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RCHY1Q96PM5 261 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CITED4Q96RK1 184 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 VSIRQ9H7M9 311 aa11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS46E5RG02 174 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 H3BP45 60 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CCSO14618 274 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 SCGB2A1O75556 95 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 IFNA21P01568 189 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ID3Q02535 119 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.13□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CRYBB3P26998 211 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 TFPI2P48307 235 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RAB11AP62491 216 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 GAMTQ14353 236 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 TCF24Q7RTU0 167 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ZMAT4Q9H898 229 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RETNQ9HD89 108 aa11.12□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 SSSCA1O60232 199 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 DFFBO76075 338 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 SCGB1D2O95969 90 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 TOMM40O96008 361 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 IL4P05112 153 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 NPPCP23582 126 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 GBGT1Q8N5D6 347 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 Q8WTZ3 238 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 SLC35E1Q96K37 410 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 METTL26Q96S19 204 aa11.11□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 OR4C46A6NHA9 309 aa11.1□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 PSG1P11464 419 aa11.1□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 BMI1P35226 326 aa11.1□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 PAX9P55771 341 aa11.1□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF90Q03938 601 aa11.1□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.1□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 U3KQE9 123 aa11.1□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP92A6NM28 416 aa11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 CCNKO75909 580 aa11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RD3LP0DJH9 198 aa11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 P2RY1P47900 373 aa11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF124Q15973 351 aa11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.09□□□□□ -0.63
CSAG1-201ENST00000361211 ENKURQ8TC29 256 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms